简化基因组测序

专注简化基因组测序

RAD- seq (Restriction-site associated DNA-sequnencing)，即基于酶切的简化基因组测序技术，是指利用限制性内切酶对基因组进行酶切，结合一定大小的插入片段文库，对其进行高通量测序，快速鉴定高准确性的变异标记（SNPs）信息用于群体进化、多态性图谱、遗传图谱构建（QTL 定位）、性状关联和辅助scaffold 组装到染色体等分析，广泛应用于系统进化、分子育种、种质资源鉴定等领域。

简化基因组测序的优势

RAD- seq (Restriction-site associated DNA-sequnencing)，即基于酶切的简化基因组测序技术能快速鉴定高准确性的变异标记（SNPs）信息用于群体进化、多态性图谱、遗传图谱构建（QTL 定位）、性状关联和辅助scaffold 组装到染色体等分析，广泛应用于系统进化、分子育种、种质资源鉴定等领域。与传统技术相比，RAD-Seq技术操作简单、不受参考基因组限制、可简化复杂基因组；另外，基于SNPs 的分子标记技术性价比高，稳定性好，在基因组中分布更加广泛，特别是适合大样本量的分析。
根据统计，2013年度发表的基于RAD-Seq研究论文是45篇，比2012年度发表的多出135%，并且比前两年度增长了400%。而且RAD技术应用范围是跨物种的，包括动物（69%），植物（22%），昆虫（7%）以及真菌（2%）。说明RAD-Seq技术正逐步被科学家所采纳于各个领域的基础研究中。

实验流程

1 对基因组进行酶切后，连接P1接头（含有barcode）；
2. 随机打断；
3. 连接P2接头；
4. 通过PCR筛选同时带有P1和P2接头的序列；片段大小选择；
5. 上机测序

推荐的靶向捕获测序工作流程

1

制备您的文库
2

高效测序
3

分析和存储数据

科学方案设计

变异检测

通过对已有参考基因组物种的不同个体进行基因组测序及差异性分析，获得大量的变异信息，并建立遗传多态性数据库，为后续功能基因挖掘提供理论基础。

查看详情
群体进化

RAD 可以做为一种tag。通过对RAD tag的测序可以获得 RAD tag 上的SNP。它能够降低基因组的复杂度，操作简便，能够快速的鉴定出高密度的SNP位点，可以广泛应用于群体进化研究。

查看详情
遗传图谱构建

通过RAD-seq 技术获得的基因组多态性分析标记SNPs，通过计算遗传连锁距离，绘制高密度遗传图谱，并可利用这些信息进行QTL 定位。与传统方法相比，具有成本低、周期短、效率高等优点。

查看详情

RAD 测序研究方案设计

变异检测

通过对已有参考基因组物种的不同个体进行基因组测序及差异性分析，获得大量的变异信息，并建立遗传多态性数据库，为后续功能基因挖掘提供理论基础。

群体进化分析

RAD（restriction association site DNA）是与酶切位点相关的 DNA。RAD 可以做为一种tag。通过对RAD tag的测序可以获得 RAD tag 上的SNP。它能够降低基因组的复杂度，操作简便，能够快速的鉴定出高密度的SNP位点，可以广泛应用于群体进化研究。

遗传图谱构建

通过RAD-seq 技术获得的基因组多态性分析标记SNPs，通过计算遗传连锁距离，绘制高密度遗传图谱，并可利用这些信息进行QTL 定位。与传统方法相比，具有成本低、周期短、效率高等优点。

我们的优势

拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，质量可靠。

拥有Illumina HiSeq 2500、MiSeq等多种高通量测序平台。

技术人员经验丰富，可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。

拥有专业的生物信息团队和超算服务器，可为合作伙伴提供全面生物信息分析服务与技术支持。

illumina 二代测序平台
PacBio单分子三代测序仪
nanopore纳米孔测序仪
Bionano单分子测序平台-Lrys系统

高性能节点服务器 | 分析无忧

基于Dell，超威等国际知名服务器供应商的支持，运用高性能刀片节点高密度计算性能，总计提供20000+核心算力，保证24x7连续生产力安全稳定。

Nvme SSD硬盘 | 让分析速度飞起来

基于Nvme SSD固态硬盘加速器，可以淋漓尽致发挥出网络计算的魅力，让你的任务计算飞起来！

高通量 | 高速率 | 无阻塞网络集群

高通量测序数据日益加大，呈指数型积累上升，必须交由高速网络提速分析。

基于以色列Infiniband技术，惠研云构建优化了集群计算性能，使得计算IO提升300%，持续数据交互速率提高到2T总带宽，保证集群中任务与数据0延迟，无阻塞。

沪ICP备13027963号