免疫共沉淀测序

免疫共沉淀测序 | 基因活性调控研究

染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质－DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，通过对目的片断的纯化与检测，从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。CHIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用，还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。

免疫共沉淀测序的优势

检测范围广：全基因组范围的免疫沉淀与测序分析；
高性价比：基于抗体富集目标区域，有效降低测序数据量；
微量样本：只需5ng（仅针对人类样本）以上免疫沉淀后的DNA，即可进行测序分析

科学方案设计

甲基化图谱
甲基化谱差异分析
甲基化与基因表达关联分析
构建疾病诊断预测模型
甲基化序列结构
甲基化与组蛋白修饰

实验流程

随着新一代测序技术的发展和成熟，染色质免疫沉淀实验与高通量测序的整合—Chromatin Immunoprecipitation Sequencing（ChIP Sequencing）可在全基因组范围对蛋白结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定，同时也为研究的深入开展打下基础。采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后，分离与其结合的基因组DNA片段，再通过高通量测序与数据分析，在全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点，并且可以基于多个样品进行差异比较。甲醛处理细胞收集细胞超声破碎---加入目的蛋白的抗体与靶蛋白-DNA复合物相互结合加入ProteinA，结合抗体-靶蛋白-DNA复合物，并沉淀---对沉淀下来的复合物进行清洗，除去一些非特异性结合---洗脱，得到富集的靶蛋白-DNA复合物---解交联，纯化富集的DNA-片断---PCR分析。

测序工作流程

1

制备您的文库
2

高效测序
3

分析和存储数据

我们的优势

拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，质量可靠。

拥有Illumina HiSeq 2500、MiSeq等多种高通量测序平台。

技术人员经验丰富，可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。

拥有专业的生物信息团队和超算服务器，可为合作伙伴提供全面生物信息分析服务与技术支持。

illumina 二代测序平台
PacBio单分子三代测序仪
nanopore纳米孔测序仪
Bionano单分子测序平台-Lrys系统

高性能节点服务器 | 分析无忧

基于Dell，超威等国际知名服务器供应商的支持，运用高性能刀片节点高密度计算性能，总计提供20000+核心算力，保证24x7连续生产力安全稳定。

Nvme SSD硬盘 | 让分析速度飞起来

基于Nvme SSD固态硬盘加速器，可以淋漓尽致发挥出网络计算的魅力，让你的任务计算飞起来！

高通量 | 高速率 | 无阻塞网络集群

高通量测序数据日益加大，呈指数型积累上升，必须交由高速网络提速分析。

基于以色列Infiniband技术，惠研云构建优化了集群计算性能，使得计算IO提升300%，持续数据交互速率提高到2T总带宽，保证集群中任务与数据0延迟，无阻塞。

沪ICP备13027963号