Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing(MeDIP-Seq)通过使用5’-甲基胞嘧啶抗体富集高甲基化的DNA片段,将基因组中的DNA甲基化区域富集后进行高通量测序。以较小的数据量,快速、高效地寻找基因组上的甲基化区域,从而比较不同细胞、组织、样本间的DNA甲基化修饰模式的差异,可广泛用于大样本量的疾病研究和分子育种研究。
MeDIP甲基化测序的优势
检测范围广:覆盖整个基因组范围的甲基化区域;
高性价比:基于抗体富集的测序方法,提高数据利用率;
精确度:非单碱基甲基化分辨率,只能定位甲基化富集区域;
偏好性:抗体富集偏向高甲基化CpG区域。
科学方案设计
甲基化图谱
甲基化谱差异分析
甲基化与基因表达关联分析
构建疾病诊断预测模型
甲基化序列结构
甲基化与组蛋白修饰
实验流程
Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing(MeDIP-Seq)通过使用5’-甲基胞嘧啶抗体富集高甲基化的DNA片段,将基因组中的DNA甲基化区域富集后进行高通量测序。以较小的数据量,快速、高效地寻找基因组上的甲基化区域,从而比较不同细胞、组织、样本间的DNA甲基化修饰模式的差异,可广泛用于大样本量的疾病研究和分子育种研究。