概述

SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)由ETH Zürich的Dr. Ruedi Aebersold团队与AB SCIEX共同研发的一项全新的质谱采集模式技术。SWATH作为一种DIA (Data Independent Acquisition)技术,将整个质谱扫描质量范围分为若干小窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,使其能够对扫描区间内的所有肽段离子进行高速一级MS扫描再进行二级MS/MS分析。因此,SWATH能够对复杂样品中几乎所有可检测的分子进行定量测定。

服务优势

实时追踪项目进展,一切动向尽在掌握。
意见直接反馈项目经理,高效解决。
可对在线项目各维度的服务进行评价。

  • 定量鉴定复杂的样品中所有分子,包括低丰度蛋白和肽段
  • 定量准确度高:定量准确度与MRM技术相当
  • 通量大:一次实验可定量检测到2000种以上蛋白
  • 完整全面信息存储,能够存储MS,MS/MS每个峰值的数据,同一样本无需进行重复检测
  • 无需像MRM技术需要提前调试样品测定方法
同位素标记和非标记技术比较
同位素标记 非同位素标记
样本标记同位素 样本非标记
样本量限制,ICAT(2),iTRAQ(8) 样本无限制
在大样本过程中,难于跟踪蛋白丰度 易跟踪蛋白风度
多数肽段难于识别 能够识别大多数肽段
难于识别和定量低丰度 能够鉴别低丰度肽段
需提前进行二级质谱蛋白鉴定 可以鉴定差异后再进行二级质谱蛋白鉴定
实验重现性高 实验重现性低

科学方案设计

  • 农林领域
  • 基础医学
  • 生物医药
  • 微生物领域
  • 海洋水产
  • 生物能源

实验流程

SWATH作为一种DIA (Data Independent Acquisition)技术,将整个质谱扫描质量范围分为若干小窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,使其能够对扫描区间内的所有肽段离子进行高速一级MS扫描再进行二级MS/MS分析。因此,SWATH能够对复杂样品中几乎所有可检测的分子进行定量测定。SWATH综合了shotgun proteomics高通量检测的特点与精准定量分析的优势,是真正意义上的全景质谱检测手段MS/MS ALL。公司采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨质谱系统,具有快速扫描速度和串联四极杆质谱系统的定量灵敏度能力,集质谱系统的高分辨、准确质量数稳定性、高灵敏度和高速度扫描特点于一身,推出SWATH定量蛋白组分析服务技术包裹,您只需要将您的样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。

原理

对于复杂样品定量分析主要的问题往往来自于样品本身高丰度蛋白的干扰,从而难以鉴定到低丰度蛋白。许多DDA(Data Dependent Acquisition)质谱鉴定方法,都是在MS级别鉴定肽段,优先筛选MS信号强的肽段进行二级碎裂,因此低丰度的肽段不易被选择进行二级分析。而SWATH/DIA则是对样品中的所有分子无差别地进行分析,并一次性将所有肽段的MS,MS/MS数据进行储存,以保证不遗漏任何可能重要的数据。总的来说,SWATH极大地提高了定量分析的可信度,并能够高效测定复杂样品中丰度极低的蛋白分子。另外,相比MRM需要根据待检测的目标分子进行检测方法优化,SWATH无偏差分析所有分子,不需要提前对检测方法进行优化,只需要在已获得检测数据的基础上对分析方法进行优化即可。因此,SWATH分析能够为您极大得缩短检测分析的周期。
DDA与SWATH/DIA质谱分析的对比

我们的优势

拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,实验周期短,质量可靠。
拥有Illumina HiSeq 2500、MiSeq等多种高通量测序平台。
技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
拥有专业的生物信息团队和超算服务器,可为合作伙伴提供全面生物信息分析服务与技术支持。
  • Sciex Triple TOF 5600+
    该系统具有超高快速扫描速度,极高质谱分辨率和定量稳定性
  • Thermo Scientific Q Exactive
    适用于非目标或目标化合物筛选,也实现广泛的定性和定量分析
  • Sciex QTrap 5500
    结合串联四级杆和线性离子阱扫描的超低定量综合分析平台
  • Waters Xevo G2-XS QTOF
    帮助鉴定最具挑战性的复杂样本中的多类化合物               
  • Sciex TOF/TOF 5800
    准确率灵敏度最高的MALDI-TOF-TOF质谱系统,用于众多ICAT,iTRAQ,
    SILAC等差异定量技术

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