5hmC 羟甲基化测序 | 基因活性调控研究

DNA羟甲基化是一种重要的表观遗传修饰,对基因的表达起调控作用,在神经分化和癌症中发挥重要的作用。为深入了解5hmC的作用,我们就必须清楚5hmC在基因组的分布情况。然而,传统的基于重亚硫酸盐的方法无法区分5-hmC和5-mc。5-hmC单克隆抗体捕获法是研究DNA羟基化修饰的利器,结合高通量测序技术以及生物信息分析,可以获得全基因组羟甲基化分布图,从而能帮助我们从一个新的角度来解析胚胎发育,神经细胞分化以及癌症发生的分子机制。

5hmC 羟甲基化测序的优势

  • 特异性检测羟甲基化: 5-hmC抗体能够区分甲基化和羟甲基化信号,特异性的检测羟甲基化区域。
  • ● 灵活度高:能够直接对任意物种的高羟甲基化片段进行测序,无需已知的基因组序列信息。
  • ● 检测范围广:覆盖整个基因组范围的羟甲基化区域。
  • ● 精确度高:能够在实际结合位点50个碱基范围内精确定位。
  • ● 数字化信号:直接对羟甲基化片段进行测序和定量,不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题。

科学方案设计

  • 甲基化图谱
  • 甲基化谱差异分析
  • 甲基化与基因表达关联分析
  • 构建疾病诊断预测模型
  • 甲基化序列结构
  • 甲基化与组蛋白修饰

实验流程

  • 1. 羟甲基化DNA免疫共沉淀(hMeDIP)
  • 2. 测序文库构建
  • 3. DNA成簇(Cluster)扩增
  • 4. 高通量测序
  • 5. 数据分析
  • 6. 提供实验报告

测序工作流程

  • 1
    制备您的文库
  • 2
    高效测序
  • 3
    分析和存储数据

我们的优势

拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,实验周期短,质量可靠。
拥有Illumina HiSeq 2500、MiSeq等多种高通量测序平台。
技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
拥有专业的生物信息团队和超算服务器,可为合作伙伴提供全面生物信息分析服务与技术支持。
  • illumina 二代测序平台
  • PacBio单分子三代测序仪
  • nanopore纳米孔测序仪
  • Bionano单分子测序平台-Lrys系统

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