蛋白质芯片-蛋白质组学研究的利器

近年来,蛋白质芯片技术呈现异军突起之势。这种简单而强大的工具为蛋白分析提供了一种经济有效的解决方案,能够快速生成大量重复且可靠的数据。与ELISA和质谱等常规工具相比,它们有着独特的优势。蛋白质芯片的一个主要优势是它们对各种浓度的靶点都具有高度灵敏,且需要的样本量低于抗体芯片。

服务优势

实时追踪项目进展,一切动向尽在掌握。
意见直接反馈项目经理,高效解决。
可对在线项目各维度的服务进行评价。

  • 芯片标准:1×25×76mm硅片片基,蛋白点径~60μm,体积0.5~1 nL;
  • 技术重复:每个蛋白点2次技术重复;
  • 荧光检测:可使用单一或多色标签;
  • 纯化体系:所有蛋白质在非变性条件下,通过真核酵母表达体系表达纯化;
  • 生产条件:温度4-8℃,湿度30~40%点样,4℃过夜固定,-80℃长期保存。

芯片蛋白分类

HuProt™20K人类蛋白组芯片通过化学修饰共价结合超过16,152种人类基因编码蛋白和124种小鼠基因编码蛋白质。这些蛋白广泛覆盖受体、转录因子、激酶、胞外基质蛋白、细胞骨架蛋白等30余种蛋白类型,可用于多种生物学功能的创新研究。

科学方案设计

  • 蛋白质相互作用谱筛选
  • DNA/RNA结合蛋白筛选
  • 自身抗体谱筛选
  • 蛋白修饰与酶底物谱鉴定
  • 小分子&单抗药物靶点筛选

实验流程

蛋白质相互作用谱筛选

蛋白质在体内基本全部以蛋白复合状态发挥功能,对蛋白复合物成员的识别和研究是认识和理解蛋白功能的关键。高通量HuProt 20K蛋白组芯片是蛋白(抗体)互作谱鉴定的有力工具,通过钓饵蛋白与芯片上包被的~2万种背景信息清晰的蛋白质进行互作反应,能够极大提高相互作用蛋白的筛选范围和工作效率。

HuProt™20K蛋白组芯片与免疫共沉淀(Co-IP)比较的优势
  • ● 无需进行克隆构建、细胞培养和转染等实验;
  • ● 无需免疫沉淀实验,不受靶蛋白表达量和共沉淀效率影响;
  • ● 直接判定互作蛋白,无需进行质谱(MS)鉴定;
  • ● 更加直观、可靠和快速,有效提高工作效率;
  • ● 待测蛋白无特异性抗体仍然可以进行检测;
  • ● 待测蛋白有无纯化标签(Tag)都可以检测;
  • ● 体外实验,覆盖范围更广泛,可鉴定更多互作蛋白类型和靶点。

DNA/RNA结合蛋白筛选

HuProt™20K 蛋白组芯片可实现蛋白质与核酸(DNA/RNA)特异性结合的高通量筛选。该芯片可迅速定位与目的核酸结合的蛋白质及其背后丰富的生物信息,在转录因子筛选、LncRNA调控、 RNA毒性、病原微生物侵袭等研究中发挥重要作用。

HuProt™20K 筛选核酸结合蛋白的技术优势
  • ● 无需进行克隆构建、细胞培养和转染等实验;
  • ● 无需细胞核蛋白的提取,不受蛋白表达水平影响;
  • ● 无需进行免疫沉淀实验,不受共沉淀效率影响;
  • ● 与EMSA、ChIP、RIP比较,更适合筛选需求;
  • ● 直接确定结合蛋白,无需进行质谱鉴定;
  • ● 快速可靠,各蛋白信息清晰,验证实验简便;
  • ● 体外实验,覆盖范围更广泛,可鉴定更多互作蛋白类型和靶点。

疾病标志物研究:自身抗体谱筛选

肿瘤、炎症、自身免疫性疾病(如:红斑狼疮、类风关、克隆氏病、多发性硬化)等多种疾病中,体内产生和累积大量的自身抗体。HuProt™20K蛋白组芯片覆盖~20000种人类蛋白质,能够结合并大规模筛选这些人类自身抗体,从而为多种疾病的诊断、预后、药效评价等提供丰富候选标志物。

HuProt™ 20K用于biomarker筛选的技术优势
  • ● 芯片覆盖近2万种人类蛋白质,获得biomarker可能性大;
  • ● 较质谱技术更适用于血清/血浆蛋白筛选;
  • ● 特别适合自身免疫病及自身抗体类疾病标志物的筛选;
  • ● 可追溯组织中自身抗体对应抗原的异常,理解发病机理;
  • ● 可订制小芯片,用于扩大样本验证实验;
  • ● 研究成果的转化应用和开发有极强便利性。

蛋白修饰与酶底物谱鉴定

HuProt™20K蛋白组芯片包含的~2万种真核生物酵母表达的人类全长蛋白质,这些蛋白具备充分的生物活性, 可以为多种蛋白修饰 (如磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化、SUMO化、NEDD化及亚硝基化等) 及酶促反应提供大量的候选底物,且每种蛋白生物信息背景清晰。以泛素化检测为例,如下图所示:

HuProt™20K 用于酶底物谱鉴定的技术优势
  • ● 芯片覆盖近2万种人类蛋白质,通量高,底物鉴定范围全面;
  • ● 可进行多种修饰酶底物谱鉴定,应用范围广;
  • ● 验证效率高,实验结果准确、全面、创新性强;
  • ● 底物背景信息清晰,方便进行生物信息分析和深入机理解析。

小分子&单抗药物靶点筛选

化学小分子和单克隆抗体是目前主要的靶向药物来源,然而经典的药物研发体系往往需要15-20年的时间才能开发出适用于临床的靶向药物,且研发失败率非常高。

HuProt™20K 蛋白质组芯片作为简便、快速和准确的药物靶点筛选实验技术,该蛋白芯片可以快速地定性和相对定量地分析经过荧光、生物素、放射性同位素标记的小分子或单克隆抗体药物与~2万种人类全长蛋白质的结合情况,判断候选分子的结合靶点和特异性,为药物研发体系的改进提供强大的技术保障。

ZEB2单抗特异性研究实例展示
A. 检验HuProt™20K 芯片质量:绿色荧光点(anti-GST),红色荧光点(Positive Control),白色方框(ZEB2蛋白);
B. 竞争药厂的ZEB2单抗特异性检测结果:白色方框(ZEB2蛋白),白色箭头(抗体结合非特异蛋白);
C. 本药厂的ZEB2单抗特异性检测结果:白色方框(ZEB2蛋白)。
结论:本药厂的ZEB2单抗靶点单一,较竞争药厂的单抗药物特异性更强,具有更优的应用价值。

我们的优势

拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,实验周期短,质量可靠。
拥有Illumina HiSeq 2500、MiSeq等多种高通量测序平台。
技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
拥有专业的生物信息团队和超算服务器,可为合作伙伴提供全面生物信息分析服务与技术支持。
  • Sciex Triple TOF 5600+
    该系统具有超高快速扫描速度,极高质谱分辨率和定量稳定性
  • Thermo Scientific Q Exactive
    适用于非目标或目标化合物筛选,也实现广泛的定性和定量分析
  • Sciex QTrap 5500
    结合串联四级杆和线性离子阱扫描的超低定量综合分析平台
  • Waters Xevo G2-XS QTOF
    帮助鉴定最具挑战性的复杂样本中的多类化合物               
  • Sciex TOF/TOF 5800
    准确率灵敏度最高的MALDI-TOF-TOF质谱系统,用于众多ICAT,iTRAQ,
    SILAC等差异定量技术

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